1993年，回國后的姚剛在證監(jiān)會(huì)擔(dān)任期貨部副主任一職，后任主任。1998年君安證券出事后他被直接點(diǎn)名主持與國泰的合并事宜，被任命為君安證券董事長，在國泰、君安證券公司合并后，被任命為總裁，當(dāng)時(shí)他只有36歲。
在2001年全國券商業(yè)績的排名中，在對(duì)證券公司業(yè)績貢獻(xiàn)最大的主承銷商排名上，國泰君安因擔(dān)任主承銷商的家數(shù)首次超過南方證券公司，排在了第一位。與此同時(shí)，國泰君安證券公司仍然有一些歷史遺留的大案要案沒有了結(jié)，最著名的是大慶聯(lián)誼案，但這些案件均發(fā)生在姚剛進(jìn)君安之前。
2002年，闊別三年的姚剛回到了證監(jiān)會(huì)，任發(fā)行監(jiān)管部主任，此后一路高升：2004年7月任證監(jiān)會(huì)主席助理、黨委委員兼發(fā)行監(jiān)管部主任；2008年任證監(jiān)會(huì)副主席、黨委委員。
